手数料は基本的に現金をもって授受を行うが、現金に代えて、例えば国の場合には
収入印紙、地方自治体の場合は
収入証紙、
郵便の場合は
切手などを購入し、書類に貼り付けることにより納付することもある。また、銀行等の
ATMを利用する際に発生する手数料(他行利用手数料や時間外手数料、振り込み手数料など)は、通例、口座残高から自動的に手数料を差し引いており、現在では
地方銀行でも手数料を取るようになっており、かつて手数料が無料とされたサービスでさえ有料化する傾向もあり、手数料とサービスが釣り合っていないという批判も絶えない(両替機の利用、土曜日の引き出しなど)。